История Little Busters! разворачивается вокруг ученика средней школы Рики Наоэ. Его родители умерли, когда он был маленьким. Их смерть стала для Рики сильным ударом, от которого он впал в депрессию. Тогда ему помогла компания из трёх мальчиков и одной девочки. Они именовали себя Little Busters — группой, посвятившей себя борьбе со злом и отстаиванием справедливости. Сейчас ребята учатся во втором классе старшей школы, где продолжаются веселиться. Они еще не знают, что в будущем их поджидают мистические события.